Rui Pedro 2001-ben 13 évesen került Portugália egyik legsikeresebb klubjához, az FC Portóhoz. A támadó középpályás rendszeres tagja volt a portugál utánpótlás válogatottaknak, 2007-ben pedig már a Porto első csapatának keretében találta magát - írja a fradi.hu.
A rendszeres játéklehetőség érdekében többször is kölcsönadták a kék-fehérek. A Gil Vicentében, majd a Leixoesben is 8 bajnoki gólt szerzett egy-egy idény alatt, majd 2011-ben Kolozsvárra igazolt, ahol a korábbi kiváló portugál hátvéd, Jorge Costa volt a vezetőedző.
A CFR Cluj csapatában Rui Pedro fokozatosan vált egyre fontosabb láncszemmé. Két fordulóval a rendkívül szoros bajnokság vége előtt a Mioveni ellen három gólpasszt osztott ki, a kolozsváriak pedig az idény végén bajnoki címet ünnepelhettek.
Mesterhármas a Bajnokok Ligájában
A következő idényben Rui Pedro a Bajnokok Ligájában szerepelhetett a kolozsvári csapattal, a Sporting Braga elleni hazai csoportmeccsen pedig mesterhármast lőtt! Az utolsó fordulóban Rui Pedróék legyőzték a Manchester Unitedet is, ám így is a csoport harmadik helyére szorult, tavasszal pedig az Európa Ligában az Inter ellen nem volt esélye a Clujnak.
A bajnokságban Rui Pedro 7 gólja ellenére a csapat csak a középmezőnyben végzett, a Román Kupában viszont döntőt játszhatott.
A Transfermarkt szerint egymillió eurót érő Rui Pedro három Kolozsváron töltött idény után hazatért, az Academica Coimbra játékosa lett. Két év alatt 9 gólig és 6 gólpasszig jutott fekete-fehérben, majd a bolgár rekordbajnok CSZKA Szófiába igazolt, amellyel második helyen végzett a pontvadászatban.